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技術(shù)文章
口蹄疫病毒 RT-PCR檢測試劑盒使用說明書
用途
口蹄疫病毒( FMDV)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)( RT-PCR),用于檢測疑似感染動(dòng)物的水皰皮或水皰液中所有血清型的 FMDV,適用于 FMDV的檢測、診斷和流行病學(xué)調(diào)查。
原理
利用離心柱內(nèi)硅基質(zhì)膜提取 RNA,在反轉(zhuǎn)錄酶的作用下,以 RNA為模板,以引物為起點(diǎn)合成與 RNA模板互補(bǔ)的 cDNA鏈。在 TaqDNA聚合酶的作用下,經(jīng)高溫變性、低溫退火、中溫延伸的循環(huán),使特異 DNA片段的拷貝數(shù)放大一倍。經(jīng)過 35次循環(huán),zui終使擴(kuò)增 DNA片段放大了數(shù)百萬倍。將擴(kuò)增 DNA片段進(jìn)行電泳,經(jīng)染色后,在紫外燈照射下,肉眼可見到 DNA片段的擴(kuò)增帶。
試劑
1.試劑盒組成
2.試劑盒保存期:6個(gè)月。
需要自備的器材
1.儀器:分析天平、離心機(jī)、 PCR擴(kuò)增儀、電泳儀、電泳槽、紫外凝膠成像儀(或紫外分析儀)、微波爐、組織研磨器、-20℃冰箱、可調(diào)移液器(2µL、20µL、200 µL、1000 µL)。
2.耗材:眼科剪、眼科鑷、稱量紙、 20mL一次性注射器、生理鹽水、瓊脂糖、 500mL量筒、500 mL錐形瓶、經(jīng)焦碳酸二乙酯( DEPC)水處理的滅菌 1.5mL離心管和吸頭( 10 µL、200µL、1000 µL)、滅菌雙蒸水。
使用注意事項(xiàng)
1.所有接觸病料的物品均應(yīng)合理處理,以免污染實(shí)驗(yàn)室。 2.PCR整個(gè)試驗(yàn)分配液區(qū)、模板提取區(qū)、擴(kuò)增區(qū)、電泳區(qū)。流程順序?yàn)榕湟簠^(qū)
名稱 | 10頭份 | 50頭份 | 貯藏條件 | 0.2 mL薄壁 PCR管 | 15個(gè) | 60個(gè) | 室溫(A盒) | 吸附柱和收集管 | 10套 | 50套 | 裂解液 | 6mL | 30 mL | 洗液 | 12 mL | 60 mL | 洗脫液 | 1mL | 10 mL | 礦物油 | 300 µL | 1.2 mL | 50倍 TAE電泳緩沖液 | 20 mL | 100 mL | 染色液 | 20 µL | 50 µL | 上樣緩沖液 | 50 µL | 250 µL | 陰性對照 | 350 µL | 1 mL | -20℃(B盒) | 陽性對照 | 350 µL | 1 mL | RT-PCR反應(yīng)液 | 200 µL | 1 mL | X液 | 5µL | 10µL | 酶混合液 | 15 µL | 65 µL | |
模板提取區(qū)擴(kuò)增區(qū)
電泳區(qū)。嚴(yán)禁器材和試劑倒流。
1 所有試劑應(yīng)在規(guī)定的溫度儲(chǔ)存, -20℃保存的各試劑使用前應(yīng)放于室溫*融化,使用后立即放回 -20℃。
2 染色液低毒,應(yīng)于室溫條件避光保存,操作時(shí)應(yīng)戴上手套。
3 注意防止試劑盒組分受污染。使用前將紅蓋管 8000 rpm離心 15 s,使液體全部沉于管底,放于
冰盒中,吸取液體時(shí)移液器吸頭盡量在液體表面層吸取。
1 不要使用超過有效期限的試劑,試劑盒之間的成分不要混用。
2 RNA提取過程中,避免 RNA酶污染,盡量縮短操作時(shí)間。
3 嚴(yán)格遵守操作說明可以獲得的結(jié)果。操作過程中移液、定時(shí)等全部過程必須。
4 反復(fù)凍融試劑將減低檢測靈敏度,建議在 3次內(nèi)用完,請嚴(yán)格按試劑盒說明書操作。
樣品制備
1樣品采集:病死或撲殺的偶蹄動(dòng)物,取潰爛或潰瘍的表皮組織等;待檢的活動(dòng)物,取水皰皮或水皰液置于 50%甘油生理鹽水中。2~8℃保存,送實(shí)驗(yàn)室檢測。(要求送檢病料新鮮,嚴(yán)禁反復(fù)凍融。) 2樣品處理:每份樣品分別處理。
1. 1組織樣品處理:每份組織分別從三個(gè)不同的位置稱取樣品約 1g,用手術(shù)剪剪碎混勻后取 0.05 g于研磨器中研磨,加入 1.5 mL生理鹽水繼續(xù)研磨,待勻漿后轉(zhuǎn)至 1.5 mL滅菌離心管中,8000rpm離心 2min,取上清液 100 µL于 1.5 mL滅菌離心管中。
2. 2水皰液處理:取 100 µL,置 1.5 mL滅菌離心管中。
3. 3陽性對照處理:取陽性對照 100µL,置 1.5mL滅菌離心管中。
4. 4陰性對照處理:取陰性對照 100µL,置 1.5mL滅菌離心管中。
操作步驟 1病毒 RNA的提取
1.1取已處理的樣品、陰性對照和陽性對照,分別加入裂解液 600µL,充分顛倒混勻,室溫靜置 3~ 5min。
1.2將液體吸入吸附柱中(吸附柱要套上收集管,吸取液體時(shí)盡量不要吸到懸浮雜質(zhì),以免離心時(shí)堵塞吸附柱),13000rpm離心 30s,棄去收集管中液體,套上收集管。
1.3向吸附柱中加入 600 µL洗液,13000 rpm離心 30 s,棄去收集管中液體,套上收集管。
1.4重復(fù)步驟 1.3。
1.5再空柱 13000rpm離心 2min。
1.6將吸附柱移入新的 1.5 mL離心管中,在膜中央加入洗脫液 25 µL,室溫靜置 1min,13000rpm離心 30 s,獲得總 RNA。 2RT-PCR操作程序
每份總體積 20 µL,含 16.8µLRT-PCR反應(yīng)液(用前混勻),1.2 µL酶混合液,2µL模板 RNA。
例如:n份樣品(n<10),配制 n+1份,16.8×(n+1)RT-PCR反應(yīng)液,再加入 1.2×(n+1)酶混合液混勻,取 18µL分裝成 n份,分別加入 2µL模板 RNA(陽性對照管加入 1µL陽性對照 RNA和 1µLX液),加入礦物油 20 µL覆蓋(有熱蓋的 PCR擴(kuò)增儀不用加礦物油),作好標(biāo)記。
在 PCR擴(kuò)增儀上進(jìn)行以下程序: 42 ℃ 45 min,95 ℃ 3min;擴(kuò)增條件為 95 ℃ 15 s,60 ℃ 30 s, 35個(gè)循環(huán); 60℃延伸 3min。 3電泳
稱 4g瓊脂糖放于 500mL錐形瓶中,加入 50倍稀釋的 TAE電泳緩沖液 200mL(取 4mL50倍 TAE電泳緩沖液,用雙蒸水稀釋至 200 mL),于微波爐中熔解,再加入 10 µL染色液混勻。在電泳槽內(nèi)放好梳子,倒入瓊脂糖凝膠,待凝固后將 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物 10 µL混合 2µL上樣緩沖液,點(diǎn)樣于瓊脂糖凝膠孔中,以 110~120V電壓于 50倍稀釋的 TAE電泳緩沖液中電泳,紫外燈下觀察結(jié)果。
結(jié)果判定
陽性對照出現(xiàn) 131 bp擴(kuò)增帶、陰性對照無帶出現(xiàn)(引物帶除外)時(shí),實(shí)驗(yàn)結(jié)果成立。被檢樣品出現(xiàn) 131 bp擴(kuò)增帶為口蹄疫病毒陽性,否則為陰性。
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