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13817140470更新時間:2010-07-06 瀏覽次數(shù):2455
基因組大小,是指一個基因組中所擁有的DNA含量,是生物進(jìn)化中zui基本的、同時也是zui復(fù)雜的遺傳特征之一。例如,生物的復(fù)雜度并不與基因組大小有顯著相關(guān),即C值悖論。作為模式物種的紅旗東方鲀和斑點綠河鲀是目前已知的具有zui小基因組大小的脊椎動物(<400Mb,僅相當(dāng)于人基因組大小的八分之一),對它們的全基因組測序分析發(fā)現(xiàn),它們卻具有與人相近的基因數(shù)目。正因為如此,河鲀基因組大小變化的研究引起關(guān)注。
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在中國科學(xué)院水生生物研究所何舜平研究員的指導(dǎo)下,博士研究生郭寶成等通過構(gòu)建刺河鲀(基因組大小為780Mb)的BAC文庫和隨機(jī)挑取克隆測序,在基因組水平對河鲀基因組大小變化進(jìn)行了研究。對10個BAC克隆、長度776 kb的刺河鲀基因組測序分析發(fā)現(xiàn),河鲀基因組大小變化同時表現(xiàn)為基因組同源區(qū)域和非同源區(qū)域長度的變化;基因組注釋結(jié)果表明,內(nèi)含子長度與河鲀基因組大小變化呈正相關(guān),刺河鲀的內(nèi)含子長度為566bp,統(tǒng)計上顯著大于紅旗東方鲀和斑點綠河鲀的內(nèi)含子長度(435bp);轉(zhuǎn)座子序列的含量和家族在不同河鲀基因組表現(xiàn)出明顯的不同,并且轉(zhuǎn)座子序列在不同河鲀基因組內(nèi)的非等速積累是造成河鲀基因組大小變化的主要機(jī)制。
這一結(jié)果被同行評價為是對在河鲀基因組大小變化傳統(tǒng)研究的重要補(bǔ)充和證明。
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