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建立蛋白質(zhì)組學(xué)平臺(tái) 解析癌癥

更新時(shí)間:2010-03-15 瀏覽次數(shù):2380

        摘要: 來自重慶醫(yī)科大學(xué)的研究人員成功建立了胃癌細(xì)胞SGC7901中高爾基體的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)路線,為胃癌細(xì)胞內(nèi)高爾基體功能的深入研究奠定了基礎(chǔ)。這一研究成果公布在《中國生物工程雜志》上。

        報(bào)道:來自重慶醫(yī)科大學(xué)的研究人員成功建立了胃癌細(xì)胞SGC7901中高爾基體的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)路線,為胃癌細(xì)胞內(nèi)高爾基體功能的深入研究奠定了基礎(chǔ)。這一研究成果公布在《中國生物工程雜志》上。

        高爾基體功能復(fù)雜,除了參與蛋白加工外,研究表明,高爾基體還能參與細(xì)胞分化及細(xì)胞間信號(hào)傳導(dǎo),并在凋亡中扮演重要角色,其功能障礙也許和腫瘤的發(fā)生、發(fā)展有某種。根據(jù)人類基因組研究,人類高爾基體約一千多種蛋白質(zhì)中僅有五、六百種得到了鑒定,如能建立一條關(guān)于高爾基體蛋白質(zhì)組成的技術(shù)路線將有助于其功能的深入研究。

 

 

        蛋白質(zhì)組學(xué)是一種有效的研究方法,特別隨著亞細(xì)胞器蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的迅猛發(fā)展,使高爾基體的全面研究變?yōu)榭尚小R虼搜芯咳藛T希望能以胃癌細(xì)胞中的高爾基體為研究對(duì)象,通過亞細(xì)胞器蛋白質(zhì)組學(xué)方法,建立胃癌細(xì)胞中高爾基體的蛋白質(zhì)組方法學(xué)。

        研究人員采用蔗糖密度梯度的超速離心方法分離純化高爾基體,雙向凝膠電泳(2-DE)分離高爾基體蛋白質(zhì),用ImageMaster 2D軟件分析所得圖譜,基質(zhì)輔助激光解吸離子化飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI—TOF MS)鑒定蛋白質(zhì)點(diǎn)等一系列亞細(xì)胞器蛋白質(zhì)組學(xué)方法建立胃癌細(xì)胞內(nèi)高爾基體的蛋白圖譜。

        結(jié)果顯示分離出的純度較高的高爾基體建立了分辨率和重復(fù)性均較好的雙向電泳圖譜,運(yùn)用質(zhì)譜技術(shù)鑒定出12個(gè)蛋白質(zhì),包括蛋白合成相關(guān)蛋白,膜融合蛋白,調(diào)節(jié)蛋白,凋亡相關(guān)蛋白,運(yùn)輸?shù)鞍?,?xì)胞增殖分化相關(guān)蛋白。通過亞細(xì)胞器分離純化,雙向電泳的蛋白分離及MALDI-TOF MS蛋白鑒定分析,成功建立了胃癌細(xì)胞SGC7901中高爾基體的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)路線。

        亞細(xì)胞器蛋白質(zhì)組學(xué)與全細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)相比,可以提高低豐度蛋白的檢出,完成蛋白質(zhì)的定位,此外還可提供有關(guān)蛋白質(zhì)在細(xì)胞器間的轉(zhuǎn)移運(yùn)輸及蛋白間的相互作用等信息。目前國內(nèi)外研究較多的是線粒體的亞細(xì)胞蛋白質(zhì)組,關(guān)于高爾基體蛋白質(zhì)組學(xué)的報(bào)道,國外也于來源于鼠肝或其他組織的高爾基體。由于其易得性,大鼠肝臟是目前高爾基體的理想來源,通過對(duì)鼠肝高爾基體的蛋白質(zhì)組學(xué)研究在發(fā)現(xiàn)新蛋白,了解鼠肝高爾基體的功能等方面已取得一定成績,但對(duì)來源于胃癌細(xì)胞內(nèi)高爾基體的蛋白研究國內(nèi)外均未見報(bào)道。

        亞細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)的三大核心技術(shù)主要包括亞細(xì)胞器分離,雙向電泳建立及質(zhì)譜分析,這一研究正是運(yùn)用此思路,完成了胃癌細(xì)胞內(nèi)高爾基體的亞細(xì)胞器分離,高爾基體雙向電泳建立及質(zhì)譜鑒定這一套完整的亞細(xì)胞器蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)路線,以期能對(duì)高爾基體在胃癌細(xì)胞內(nèi)功能的深入研究奠定基礎(chǔ)。

        高爾基體是種膜性細(xì)胞器,通過“鳥槍”蛋白組學(xué)途徑可以檢測出高爾基體上極酸極堿及疏水性蛋白,利于高爾基體蛋白的全面認(rèn)識(shí)。但雙向電泳的蛋白分離,對(duì)研究胃癌細(xì)胞高爾基體來說,更加直觀,能對(duì)其在pH3-10范圍的蛋白組成及布情況有個(gè)非常清楚明了的感官認(rèn)識(shí),所以即使在對(duì)胃癌細(xì)胞高爾基體上的蛋白沒有任何了解的情況下,重復(fù)性好的2D膠也能*時(shí)間展示出蛋白組成及分布情況。從建立的高爾基體電泳圖譜中,可見蛋白點(diǎn)紋理邊界清晰,蛋白點(diǎn)基本被分離開來,此后的質(zhì)譜鑒定也可看出幾乎每個(gè)蛋白點(diǎn)只代表了一個(gè)蛋白質(zhì),且穩(wěn)定的雙向電泳圖具有很高的匹配性和重復(fù)性。這些均說明用這一實(shí)驗(yàn)方法建立的高爾基體的雙向電泳是可行的。該雙向電泳圖譜是胃癌細(xì)胞SGC7901中高爾基體蛋白質(zhì)分布情況的再現(xiàn),為我們認(rèn)識(shí)高爾基體上的蛋白提供可能。

        除此之外,質(zhì)譜分析等都說明了這一實(shí)驗(yàn)中鑒定的這些蛋白的功能提示在胃癌細(xì)胞內(nèi)它們也發(fā)揮著重要的作用,通過實(shí)驗(yàn)建立的技術(shù)平臺(tái)提供了認(rèn)識(shí)胃癌細(xì)胞上高爾基體蛋白成分的方法學(xué),有利于深入研究高爾基體與胃癌間的作用。

        總的說來運(yùn)用亞細(xì)胞器分離,雙向電泳及質(zhì)譜技術(shù),胃癌細(xì)胞SGC7901內(nèi)高爾基體這一細(xì)胞器的亞細(xì)胞蛋白質(zhì)組技術(shù)方法被成功建立。該技術(shù)平臺(tái)的建立開啟了對(duì)胃癌細(xì)胞高爾基體的蛋白組成情況的全面認(rèn)識(shí)的大門,有利于高爾基體功能的深入研究。此技術(shù)路線并為胃癌細(xì)胞間及正常胃上皮細(xì)胞間高爾基體的比較蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)展奠定基礎(chǔ)。

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